Os inibidores do C1orf49 abrangem um conjunto diversificado de compostos químicos que interferem com várias vias de sinalização, conduzindo, em última análise, a uma diminuição da atividade funcional do C1orf49. A esturosporina, o LY 294002 e a Wortmannin têm como alvo as vias relacionadas com a cinase, sendo o primeiro um inibidor de cinase de largo espetro que pode reduzir a atividade do C1orf49 se for regulada pela fosforilação de proteínas, enquanto os dois últimos inibem especificamente a PI3K, diminuindo potencialmente a atividade do C1orf49 como parte da cascata de sinalização PI3K/AKT. A rapamicina, ao inibir a mTOR, pode ter impacto na atividade do C1orf49 se houver envolvimento na via da mTOR. Da mesma forma, os inibidores que têm como alvo diferentes componentes da via MAPK, incluindo PD 98059, SB 203580, SP600125 e U0126, também poderiam levar indiretamente à diminuição da função do C1orf49, assumindo uma relação reguladora entre o C1orf49 e a via MAPK.
Além disso, o PP 2, como inibidor da Src quinase, e o Bortezomib, como inibidor do proteassoma, poderiam resultar na redução da atividade do C1orf49, afectando a sinalização a montante ou a estabilidade da proteína que regula o C1orf49. O propionato de fluticasona, um inibidor específico da Gs alfa, poderia atenuar a atividade do C1orf49 alterando a sinalização do recetor acoplado à proteína G que envolve a subunidade Gs alfa. Por último, a queleritrina, que inibe a PKC, poderia potencialmente levar a uma diminuição da atividade do C1orf49 se as vias mediadas pela PKC regulassem a proteína. Coletivamente, estes inibidores exercem os seus efeitos diminuindo as vias de sinalização ou os processos celulares que se presume regularem ou afectarem a atividade da C1orf49, inibindo assim indiretamente a proteína sem afetar os seus níveis de expressão. Cada inibidor, ao atuar no seu alvo específico, contribui para uma regulação negativa concertada da funcionalidade do C1orf49 através de uma abordagem multifacetada à interferência de vias.
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