Os inibidores de C1orf216 abrangem uma gama de compostos químicos que interagem com várias vias de sinalização celular para, em última análise, levar à inibição da função da proteína. A esturosporina, como inibidor de quinase de largo espetro, pode inibir o C1orf216 indiretamente, bloqueando processos de fosforilação essenciais, enquanto a rapamicina actua através da via mTOR para alterar potencialmente a atividade das proteínas da rede mTOR de que o C1orf216 pode depender. A ação da ciclopamina na via de sinalização Hedgehog também pode afetar o C1orf216 se este for um componente dessa via. O LY 294002 e o U0126, ao visarem as enzimas PI3K e MEK, respetivamente, poderiam reduzir a atividade do C1orf216 através da sua influência reguladora nas vias PI3K/Akt e MAPK/ERK. O SB 203580 e o PD 98059, como inibidores da p38 MAPK e da MEK, podem potencialmente alterar a função do C1orf216 através da modulação das cascatas de sinalização relacionadas.
Para influenciar ainda mais a atividade funcional do C1orf216, existem compostos como o Bortezomib e o MG-132, que inibem o proteassoma, levando potencialmente à estabilização dos reguladores negativos do C1orf216 e diminuindo assim a sua atividade. O SP600125 e o WZ8040 são inibidores da JNK e da NUAK, respetivamente, oferecendo uma inibição indireta do C1orf216 através dos seus efeitos nas vias de sinalização que podem controlar a sua função. Finalmente, o ZM-447439 tem como alvo as cinases Aurora, que, se estiverem envolvidas nos mesmos processos de regulação do ciclo celular que o C1orf216, poderão resultar numa diminuição da atividade. Coletivamente, estes inibidores químicos demonstram a intrincada teia de vias de sinalização celular que regulam a função das proteínas e oferecem várias vias para conseguir a inibição específica de proteínas como a C1orf216
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