Os inibidores do C11orf80 incluem uma variedade de compostos que diminuem indiretamente a atividade funcional do C11orf80 através da inibição de vias de sinalização específicas ou de processos biológicos em que este possa estar envolvido. A Wortmannin e o LY294002 são inibidores potentes da PI3K, um regulador-chave da via AKT, que é crucial para muitos processos celulares, incluindo o metabolismo, a sobrevivência e o crescimento. A inibição desta via poderia resultar numa diminuição da atividade funcional do C11orf80 se este dependesse da sinalização PI3K/AKT. A rapamicina tem como alvo específico o mTORC1, um efetor a jusante na via AKT, e sua inibição também poderia reduzir a atividade do C11orf80 se ele operar nessa via.
Os inibidores da MEK, como o PD98059 e o U0126, levariam a uma diminuição da atividade do C11orf80 ao impedir a ativação da via ERK1/2, que está envolvida na proliferação e diferenciação celular. A JNK e a p38 MAPK são outras proteínas quinases activadas por mitogénio que regulam a apoptose e a inflamação, respetivamente. O SP600125 e o SB203580, como inibidores específicos destas cinases, diminuiriam a atividade do C11orf80 se este fosse regulado por qualquer uma destas vias.
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