Os inibidores químicos do BC006662 podem exercer os seus efeitos inibitórios através de vários mecanismos moleculares, afectando a atividade da proteína nas suas vias de sinalização. A esturosporina, um potente inibidor da proteína quinase, pode inibir a atividade da quinase que é essencial para os eventos de fosforilação, que podem ser cruciais para a funcionalidade do BC006662. Do mesmo modo, a capacidade da genisteína para inibir as tirosina-quinases pode interferir com as cascatas de fosforilação de que o BC006662 pode depender para a sua ativação ou funções reguladoras. A bisindolilmaleimida I tem como alvo a proteína quinase C, cuja inibição pode perturbar as vias de sinalização que convergem para o BC006662, levando a uma diminuição da sua atividade.
O LY294002 e a Wortmannin inibem a PI3K, que é um componente essencial em muitas vias de sinalização, incluindo as que regulam a sobrevivência e o crescimento celular que podem envolver o BC006662. Ao inibir a PI3K, estes produtos químicos podem impedir a sinalização a jusante necessária para a atividade do BC006662. O PD168393, ao inibir irreversivelmente as quinases EGFR, pode bloquear a fosforilação e a subsequente sinalização que pode ser necessária para o funcionamento correto do BC006662. A PP2, que tem como alvo a família de cinases Src, pode interromper os processos de fosforilação que podem ativar o BC006662 diretamente ou visar proteínas da sua rede reguladora.
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