Os inibidores químicos da apolipoproteína L 11a funcionam interferindo com várias vias e processos de sinalização celular que são essenciais para a atividade da proteína. O Alisertib, por exemplo, tem como alvo a aurora quinase A, um regulador-chave da mitose, perturbando o alinhamento e a segregação adequados dos cromossomas. Esta perturbação pode levar indiretamente à inibição da apolipoproteína L 11a, impedindo a sua dobragem ou secreção adequadas nas células em divisão. Do mesmo modo, o mecanismo do Palbociclib envolve a inibição das cinases dependentes da ciclina, CDK4 e CDK6, que são fundamentais para a progressão do ciclo celular. Isto resulta numa redução dos factores necessários para o papel da apolipoproteína L 11a no crescimento e viabilidade celular.
A via MAPK/ERK, fundamental para as modificações pós-traducionais de muitas proteínas, incluindo a apolipoproteína L 11a, pode ser inibida pelo trametinib, que tem como alvo a MEK1 e a MEK2. Esta inibição pode levar a uma diminuição da atividade funcional da apolipoproteína L 11a. O LY294002 e o Omipalisib têm como alvo vias de sinalização essenciais para a sobrevivência e o metabolismo das células - sendo o LY294002 um inibidor da PI3K e o Omipalisib um inibidor da PI3K e da mTOR. A inibição destas vias pode alterar o ambiente pós-tradução da apolipoproteína L 11a, diminuindo assim a sua atividade funcional. O dasatinib, ao inibir as cinases da família Src, pode interromper várias vias de sinalização que, de outra forma, poderiam estabilizar ou facilitar a função da apolipoproteína L 11a na célula. O venetoclax, que tem como alvo a proteína Bcl-2 e promove a apoptose, pode reduzir o número de células viáveis que expressam a apolipoproteína L 11a, reduzindo assim indiretamente a capacidade funcional da proteína. A talidomida actua ao afetar o sistema ubiquitina-proteassoma, diminuindo potencialmente a degradação das proteínas que regulam a atividade da apolipoproteína L 11a. A ligação irreversível do ibrutinib à tirosina quinase de Bruton resulta numa alteração da sinalização celular que pode inibir factores envolvidos na estabilidade ou na função da apolipoproteína L 11a. A rapamicina, através da sua inibição do mTOR, pode levar a uma diminuição dos processos celulares essenciais para a plena expressão funcional da apolipoproteína L 11a. Por último, a inibição de JAK1 e JAK2 pelo Ruxolitinib pode interromper a sinalização de citocinas crucial para a manutenção das condições celulares favoráveis à atividade da apolipoproteína L 11a, enquanto a inibição das cinases RAF pelo Sorafenib pode levar à redução da ativação de proteínas na via MAPK/ERK, afectando ainda mais a apolipoproteína L 11a.
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