A L-Carnitina, uma molécula essencial para o transporte dos ácidos gordos para as mitocôndrias, que apoia o papel do ACSM2B aumentando a disponibilidade de substratos para a oxidação. Esta ação é complementada pelo malonil-CoA, que, ao servir de molécula reguladora da oxidação dos ácidos gordos, pode afetar a função da ACSM2B através de mecanismos de feedback intracelular. O ácido nicotínico, conhecido pelo seu envolvimento no metabolismo dos lípidos, pode regular positivamente os genes relacionados com o metabolismo dos ácidos gordos, promovendo assim a expressão e a atividade da enzima ACSM2B. Estas moléculas que activam os receptores activados por proliferadores de peroxissoma (PPAR), como o bezafibrato, o fenofibrato e o WY-14643, activam os genes que codificam as enzimas envolvidas na oxidação dos ácidos gordos. A regulação positiva destes genes pode levar a uma maior atividade da ACSM2B, dado o seu papel nesta via metabólica. O Ob (hBA-147), associado ao gasto energético, pode também influenciar a expressão e a atividade de enzimas como a ACSM2B, afectando as exigências metabólicas.
Compostos como o C75 e o ácido alfa-lipóico, embora distintos nas suas acções primárias, contribuem para um ambiente celular que favorece a oxidação dos ácidos gordos - um processo em que o ACSM2B é um interveniente fundamental. Ao inibir a síntese de ácidos gordos e ao otimizar a função mitocondrial, respetivamente, estes compostos podem criar uma mudança que promove a atividade enzimática do ACSM2B. Além disso, activadores como o SRT1720, que visam as vias da sirtuína, podem amplificar a função mitocondrial e a oxidação dos ácidos gordos, reforçando indiretamente o papel do ACSM2B nestas vias. Os efeitos de antioxidantes como o 3,4-Dihidroxifenil Etanol estendem-se às enzimas envolvidas no metabolismo dos lípidos, afectando potencialmente o ACSM2B. O ácido eicosa-5Z,8Z,11Z,14Z,17Z-pentaenóico (20:5, n-3) é conhecido por afetar o metabolismo lipídico e a expressão genética, o que pode resultar num aumento da atividade da ACSM2B.
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