Os inibidores que têm como alvo a subunidade grande do fator de montagem da cromatina dependente de ATP (ACF) são cruciais na modulação do seu papel na montagem dos nucleossomas e na remodelação da cromatina. Os compostos que alteram a modificação pós-traducional das histonas, como os inibidores da histona desacetilase, aumentam a acetilação das histonas, resultando num estado de cromatina mais relaxado que reduz a capacidade do ACF para interagir com a cromatina e montar os nucleossomas de forma eficaz. Do mesmo modo, os inibidores que afectam os padrões de metilação do ADN e as propriedades de ligação ao ADN, como os inibidores da metiltransferase do ADN e os inibidores da ligação à sequência rica em G-C, podem impedir o recrutamento e a subsequente atividade da ACF em loci genómicos específicos. Esta perturbação na paisagem da cromatina pode levar a uma diminuição da procura dos serviços de montagem da cromatina da ACF.
Além disso, a regulação da função da ACF estende-se à influência dos processos celulares e à disponibilidade de factores relacionados com a modificação da cromatina. Os inibidores do proteassoma, os agentes desreguladores dos microtúbulos e os inibidores da quinase que modulam a atividade dos factores de transcrição e a progressão do ciclo celular podem afetar indiretamente a função de montagem da cromatina da ACF. Estes inibidores podem levar a uma acumulação de proteínas polubiquitinadas e a alterações na dinâmica celular, o que, por sua vez, pode reduzir a necessidade de remodelação da cromatina pela ACF. Os inibidores da RNA polimerase II, das proteínas de bromodomínio e das histonas acetiltransferases também contribuem para a redução da atividade funcional da ACF, diminuindo a necessidade de montagem de nucleossomas em resposta a alterações transcricionais e alterando as marcas epigenéticas que orientam o processo de remodelação da cromatina.
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