Os inibidores da EPG5 englobam um grupo de compostos que podem interferir indiretamente com a função da proteína EPG5 relacionada com a autofagia, visando várias fases da via autofágica. Estes inibidores actuam perturbando a formação de autofagossomas, impedindo a sua maturação ou obstruindo a fusão entre autofagossomas e lisossomas, uma etapa crítica em que a EPG5 participa. Por exemplo, a 3-Metiladenina, a Wortmannina e o LY294002 são inibidores potentes das fosfoinositídeos 3-quinases (PI3K), que são essenciais para o início da formação de autofagossomas. A inibição das PI3Ks leva à redução do fluxo autofágico, limitando assim a disponibilidade de autofagossomas para a EPG5 se ligar e fundir com os lisossomas.
Do mesmo modo, compostos como a cloroquina e o seu derivado mais potente, a hidroxicloroquina, acumulam-se nos lisossomas e aumentam o pH, o que interfere com a via de degradação lisossómica. Este aumento do pH pode impedir as etapas finais da autofagia, nas quais o EPG5 está ativamente envolvido. Outros inibidores, como a Bafilomicina A1 e a Concanamicina A, têm como alvo a H+-ATPase do tipo vacuolar, levando a uma acidificação falhada dos autofagossomas e lisossomas, que é um pré-requisito para a sua fusão. O agente desregulador de microtúbulos Vinblastina também pode afetar indiretamente a função da EPG5 ao afetar o transporte de autofagossomas. Por último, inibidores específicos como o SAR405, o Spautin-1 e o NSC185058 têm como alvo vários componentes da maquinaria autofágica a montante da EPG5, modulando assim o papel da proteína ao afetar a formação e a maturação dos autofagossomas.
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