Estes compostos podem afetar a função do MRNIP, alterando os processos celulares e as vias de sinalização em que o MRNIP está envolvido. Os inibidores das cinases ATM e ATR, como o KU-55933 e o VE-821, podem alterar a ativação e o recrutamento de proteínas na resposta aos danos no ADN, o que pode afetar indiretamente a função do MRNIP. Os compostos que inibem outras proteínas da via DDR, como o inibidor da DNA-PKcs, NU7441, e o inibidor da MRE11, Mirin, também podem modular a atividade do MRNIP ao perturbar a sua interação com o complexo MRN.
Além disso, as alterações na estrutura da cromatina, na progressão do ciclo celular e na via geral da DDR também podem influenciar a função do MRNIP. A tricostatina A e a 5-azacitidina, ao afectarem a remodelação da cromatina e a atividade da DNA metiltransferase, respetivamente, podem criar alterações no ambiente celular que podem afetar o funcionamento do MRNIP. Do mesmo modo, compostos como a cloroquina e o nocodazol, que afectam a autofagia e o ciclo celular, podem afetar indiretamente o papel do MRNIP na DDR.
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