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Zic2 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-404720-ACT | 20 µg | $397.00 |
ZIC2 は亜鉛フィンガー型転写因子 Zic2 をコードしており、初期胚のパターニングや神経発生に関わる遺伝子プログラムを制御する主要なレギュレーターです。Zic2 はシス調節領域に結合して、神経管形成、前脳の規定、細胞運命決定に関与する転写ネットワークを制御し、モルフォゲン応答やクロマチン状態の転換を形作る経路とも交差します。ZIC2 の発現や機能の異常は、全前脳胞症(holoprosencephaly)を含む発生異常と関連しており、また ZIC2 を含む転写回路の変化は複数のがんにおいて報告されています。DNA 結合性の制御因子として、Zic2 はヒト細胞モデルにおける遺伝子制御ネットワーク、系譜規定、転写因子駆動型フェノタイプを解析するための扱いやすい標的(ノード)となります。
Zic2 CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性ZIC2の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
Zic2 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における ZIC2 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はZIC2転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性Zic2の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のZIC2遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるZic2依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびZIC2発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるZic2経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。