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TTF-1/Thyroid Transcription Factor 1/NKX2-1 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-400458-ACT | 20 µg | $397.00 | |||
TTF-1/Thyroid Transcription Factor 1/NKX2-1 CRISPR Activationプラスミド (h2) | sc-400458-ACT-2 | 20 µg | $397.00 |
NKX2-1は、ホメオボックス型転写因子TTF-1(Thyroid Transcription Factor 1としても知られる)をコードしており、甲状腺・肺・前脳の発生および分化に必要な転写プログラムを統合して制御する、内胚葉由来臓器の系譜決定因子(lineage-determining regulator)である。甲状腺では、NKX2-1はホルモン生合成や上皮極性に関与する遺伝子の発現を制御し、肺上皮ではサーファクタントの恒常性と肺胞成熟を調節する。さらにNKX2-1は、WNT、BMP、FGFシグナル伝達など他の発生経路とも連携し、組織特異的な遺伝子発現状態の確立と維持に寄与する。NKX2-1活性の異常は、先天性の甲状腺および呼吸器の表現型と関連し、系譜可塑性やがん性転写ネットワークを含む甲状腺・肺疾患の生物学研究において、分子マーカーおよび機能的ハブとして頻繁に利用されている。
TTF-1/Thyroid Transcription Factor 1/NKX2-1 CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性NKX2-1の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
TTF-1/Thyroid Transcription Factor 1/NKX2-1 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における NKX2-1 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はNKX2-1転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性TTF-1/Thyroid Transcription Factor 1/NKX2-1の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のNKX2-1遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるTTF-1/Thyroid Transcription Factor 1/NKX2-1依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびNKX2-1発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるTTF-1/Thyroid Transcription Factor 1/NKX2-1経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。