Sulfo-SDA (Sulfo-NHS-Diazirine)

El Sulfo-SDA, también conocido como Sulfo-NHS-Diazirina, es un reactivo químico especializado ampliamente utilizado en el campo de la bioquímica para el marcaje por fotoafinidad, en particular en el estudio de las interacciones proteína-proteína y proteína-ligando. Este compuesto está formado por un grupo sulfo-NHS (N-hidroxisulfosuccinimida) y un grupo diazirina, cada uno de los cuales aporta funcionalidades distintas que aumentan su utilidad en la investigación experimental. El éster sulfo-NHS del Sulfo-SDA facilita su conjugación con los grupos amino primarios de las proteínas, normalmente los grupos amino de los residuos de lisina o los N-terminales de péptidos y proteínas. Esta reacción forma enlaces amida estables, marcando eficazmente la proteína con el grupo diazirina fotoactivable. El grupo sulfo aumenta la solubilidad del compuesto en agua, lo que lo hace muy adecuado para su uso en diversas condiciones fisiológicas sin necesidad de disolventes orgánicos. La diazirina, como grupo funcional crucial en el Sulfo-SDA, sirve como reticulante fotoactivable. Tras la exposición a la luz ultravioleta, el grupo diazirina genera un intermedio carbeno altamente reactivo. Este intermediario puede formar rápida y no selectivamente enlaces covalentes con estructuras moleculares cercanas, incluidas proteínas y otras biomoléculas. Esta propiedad es fundamental para captar interacciones moleculares fugaces dentro de sus contextos biológicos nativos, proporcionando una valiosa información sobre los procesos dinámicos que tienen lugar dentro de las células vivas. El Sulfo-SDA se ha utilizado ampliamente en biología molecular y proteómica para cartografiar redes de interacción, investigar la topología de los complejos proteínicos y explicar los mecanismos de los ensamblajes biomoleculares. La capacidad de enlazar permanentemente in situ moléculas que interactúan lo convierte en una herramienta indispensable en el arsenal de métodos para estudiar sistemas biológicos complejos.