SET7/9 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (r): sc-437354

Übersicht

SET7/9 (auch als SETD7 bekannt) ist eine Lysin-Methyltransferase, die überwiegend die Monomethylierung von Histon H3 an Lys4 (H3K4me1) katalysiert und zudem Nicht-Histon-Substrate modifizieren kann, wodurch sie Transkriptionsausgänge und Proteinstabilität beeinflusst. In Rattenzellen ist die Aktivität von SET7/9 in die Chromatin-Remodellierung eingebunden und reguliert die Zellzykluskontrolle, Differenzierungsprogramme sowie die stressresponsive Genexpression. Über eine methylierungsabhängige Wechselwirkung mit Signalwegen, die mit der p53-Signalkaskade und der NF-κB-assoziierten entzündlichen Transkription verknüpft sind, beeinflusst SET7/9 die Genomstabilität und die stimulusinduzierte Transkriptionsdynamik. Eine dysregulierte SET7/9-Funktion wurde mit epigenetischen Veränderungen in Verbindung gebracht, die für die Krebsbiologie sowie für metabolische und kardiovaskuläre Phänotypen und Modelle entzündlicher Erkrankungen relevant sind, was SET7/9 als mechanistischen Knotenpunkt in der Epigenetikforschung stützt.

Das SET7/9 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (r) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des -Gens in rat-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des -Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die SET7/9-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von -defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der SET7/9-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf -Exone abzielen, die für die SET7/9-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere -Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom SET7/9 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (r) und vom SET7/9 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (r2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des -Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das SET7/9 HDR-Plasmid (r) und SET7/9 HDR-Plasmid (r2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von -Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten -Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.