SDF-4 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (m): sc-422857

概要

Sdf4 は、カルシウム恒常性および分泌経路の機能に関与するとされる小胞体（ER）局在タンパク質、ストローマ細胞由来因子4（SDF-4）をコードします。SDF-4 は ER の品質管理やタンパク質トラフィッキングに関わる過程と関連しており、小胞輸送や細胞ストレス応答に影響を及ぼします。これらの役割を通じて、Sdf4 は分泌依存的な細胞間コミュニケーションや組織恒常性に結び付くシグナル伝達プログラムに影響し得ます。ER におけるカルシウム制御やプロテオスタシスの破綻は、代謝機能障害、神経変性、炎症性表現型の基盤となる機序に関連するため、Sdf4 は経路に焦点を当てた研究に有用なノードとなります。

SDF-4 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）は、mouse細胞株におけるSdf4遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、Sdf4内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、Sdf4のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、SDF-4タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、SDF-4シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、Sdf4欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• SDF-4の機能に不可欠なSdf4エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、Sdf4ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• SDF-4 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）およびSDF-4 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m2）によってコードされるgRNAは、Sdf4遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  SDF-4 HDRプラスミド（m）および SDF-4 HDRプラスミド（m2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはSdf4ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のSdf4標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。