SART-2 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-407069

概要

DSEはデルマタン硫酸エピメラーゼをコードする遺伝子であり、ER／ゴルジ体に局在する酵素として、コンドロイチン硫酸／デルマタン硫酸鎖中のD-グルクロン酸をL-イズロン酸へ変換することで、プロテオグリカンの構造と細胞外マトリックス（ECM）の性質を規定します。グリコサミノグリカン組成を調節することにより、DSEはコラーゲン線維形成、細胞―マトリックス接着、ならびに増殖因子の利用可能性に影響し、TGF-βなどのECM応答性経路を含むシグナル伝達プログラムに波及し得ます。デルマタン硫酸生合成の変化は、結合組織の表現型や間質リモデリングの制御異常と関連づけられており、DSEの攪乱は線維化や腫瘍微小環境の生物学などの文脈で研究されています。また、本遺伝子は文献によってはタンパク質名SART-2としても言及され、注釈（アノテーション）の慣例により、抗原研究や発現解析でその名称が用いられることがあります。

SART-2 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるDSE遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、DSE内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、DSEのオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、SART-2タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、SART-2シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、DSE欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• SART-2の機能に不可欠なDSEエクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、DSEゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• SART-2 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびSART-2 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、DSE遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  SART-2 HDRプラスミド（h）および SART-2 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはDSEホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のDSE標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。