PRAP1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (m): sc-423619
- 対象生物種: mouse
- 20 µg のトランスフェクション準備済み、精製したプラスミドDNA、～20回トランスフェクション
- PRAP1 CRISPR/Cas9 ノックアウト（KO）プラスミド（m）は、GeCKO v2ライブラリ由来の配列を用いて最大のノックアウト効率を実現するよう設計された、Cas9ヌクレアーゼおよび標的特異的な20塩基対のガイドRNA（gRNA）をそれぞれコードするプラスミドのプールです
- gRNA配列は、Cas9を誘導してPRAP1ゲノム座において部位特異的な二本鎖切断（DSBs）を引き起こし、非相同末端結合（NHEJ）を介して遺伝子ノックアウトをもたらします
- ピューロマイシン耐性遺伝子とRFP遺伝子はLoxP部位で挟まれているため、安定したノックアウト細胞株を樹立した後、Creリコンビナーゼ（Creベクター：sc-418923）を用いて選択マーカーを除去することができる。
注文情報
| 製品名 | カタログ # | 単位 | 価格 | 数量 | お気に入り | |
PRAP1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (m) | sc-423619 | 20 µg | $397.00 |
概要
プロリンリッチ酸性タンパク質1（PRAP1）は、マウスのPrap1遺伝子によりコードされる上皮関連因子で、消化管組織に多く存在し、腸管腔内ストレスに対する細胞応答と関連しています。PRAP1の発現は、炎症性シグナルや増殖因子シグナルによって制御されており、STAT下流の経路や、粘膜バリア機能を形作る核内受容体ネットワークなどが関与します。報告されている役割としては、組織損傷および修復の過程における上皮細胞の生存、分化、再生プログラムの調節が挙げられます。PRAP1の発現異常は、腸管の恒常性の変化や炎症関連疾患の文脈と関連づけられており、上皮のストレス適応機構とバリア完全性を結び付ける仕組みを解析する上で有用です。
PRAP1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）は、mouse細胞株におけるPrap1遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、Prap1内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。
このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、Prap1のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、PRAP1タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。
このCRISPRノックアウトシステムにより、PRAP1シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、Prap1欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。
主な特徴
- PRAP1の機能に不可欠なPrap1エクソンを標的とするsgRNA
導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
ノックアウト効率を向上させるための、Prap1ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
トランスフェクションによる導入に対応
設計バリエーション
CRISPRs +/- HDR
- PRAP1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）およびPRAP1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m2）によってコードされるgRNAは、Prap1遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
PRAP1 HDRプラスミド（m）および PRAP1 HDRプラスミド（m2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはPrap1ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のPrap1標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。