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Nkx-2.3 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-406709-ACT | 20 µg | $397.00 | |||
Nkx-2.3 CRISPR Activationプラスミド (h2) | sc-406709-ACT-2 | 20 µg | $397.00 |
NKX2-3 は、ホメオボックス型転写因子 Nkx-2.3 をコードしており、配列特異的に DNA に結合して遺伝子発現を制御する因子です。発生過程および成体組織において、領域特異的なアイデンティティ(地域性)プログラムの確立と維持に寄与します。上皮および間葉系の分化、組織パターニング、細胞運命決定を制御する転写ネットワークに影響を与え、その下流では系譜特異的な遺伝子発現や微小環境シグナル伝達にも波及します。NKX2-3 活性の変化は、粘膜免疫恒常性や腸管生物学の破綻と関連づけられており、炎症に関連する遺伝子制御や疾患関連の転写回路の研究における重要性を支持します。プロモーターおよびエンハンサー要素で機能する核内因子として、Nkx-2.3 は文脈依存的な転写制御機構を解析するうえで有用なノードとなります。
Nkx-2.3 CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性NKX2-3の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
Nkx-2.3 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における NKX2-3 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はNKX2-3転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性Nkx-2.3の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のNKX2-3遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるNkx-2.3依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびNKX2-3発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるNkx-2.3経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。