IRX1 Plasmídeo CRISPR/Cas9 KO (m): sc-421153

Visão geral

Irx1 codifica o fator de transcrição homeobox Iroquois IRX1, um regulador nuclear que se liga ao DNA e que padroniza tecidos embrionários e orienta a especificação de linhagens celulares. No desenvolvimento do camundongo, o IRX1 contribui para programas transcricionais que governam a morfogênese, decisões de destino celular e a organização espacial de primórdios de órgãos, integrando-se a redes regulatórias mais amplas dirigidas por homeobox. A expressão desregulada de IRX1 ou alterações no seu controle regulatório têm sido associadas a anomalias do desenvolvimento e vêm sendo estudadas no contexto de estados de diferenciação aberrantes relevantes para a biologia do câncer. Como um nó transcricional, o IRX1 é comumente investigado quanto aos seus genes-alvo a jusante, dependências do estado da cromatina e interação cruzada com vias de sinalização que moldam a identidade tecidual.

O Plasmídeo CRISPR/Cas9 KO IRX1 (m) é um conjunto de plasmídeos concebido para a interrupção direcionada do gene Irx1 em linhas celulares mouse. Cada plasmídeo coexpressa um RNA guia único (sgRNA) direcionado a um local distinto dentro do Irx1, juntamente com a nuclease Cas9 de Streptococcus pyogenes. Os plasmídeos também codificam GFP, permitindo a identificação fluorescente e o enriquecimento de células transfectadas com sucesso por microscopia de fluorescência ou citometria de fluxo.

O design multiguia aumenta a probabilidade de gerar inserções ou deleções (indels) que interrompem o quadro de leitura aberto do Irx1 na sequência da formação de quebras de cadeia dupla mediadas por Cas9. As quebras de ADN introduzidas pelo sistema CRISPR/Cas9 são reparadas através de vias endógenas de junção de extremidades não homólogas (NHEJ), resultando frequentemente em mutações de deslocamento de quadro que abolir a expressão da proteína IRX1.

Este sistema de knockout CRISPR permite a geração eficiente de modelos celulares com deficiência de Irx1 para a investigação da sinalização de IRX1, estudos de genómica funcional, investigação em biologia do cancro e avaliação de respostas terapêuticas em linhas celulares humanas.

Características principais

• sgRNAs direcionados para o(s) exão(ões) Irx1 críticos para a função IRX1
  Coexpressão de SpCas9 e sgRNA a partir de um único plasmídeo para simplificar a administração
  Repórter GFP para identificação de células transfectadas
  Conjunto de plasmídeos direcionados para múltiplos locais genómicos Irx1 para melhorar a eficiência do knockout
  Compatível com administração por transfecção

Variantes de Design

CRISPRs +/- HDRs

• Os gRNAs codificados pelo IRX1 Plasmídeo CRISPR/Cas9 KO (m) e pelo IRX1 Plasmídeo CRISPR/Cas9 KO (m2) têm como alvo locais distintos dentro do locus Irx1. Pode estar disponível um ou ambos os designs de alvo. Consulte Produtos Relacionados para verificar a disponibilidade.
  As construções doadoras HDR codificadas pelo IRX1 Plasmídeo HDR (m) e o Plasmídeo HDR IRX1 (m2) contêm uma cassete de resistência à puromicina e um repórter RFP flanqueado por braços de homologia Irx1 para suportar a reparação dirigida por homologia em locais-alvo Irx1 definidos, correspondentes aos desenhos de KO CRISPR/Cas9. A disponibilidade do doador HDR pode variar. Consulte Produtos Relacionados para verificar a disponibilidade.

Apenas para uso em investigação. Não se destina a uso diagnóstico ou terapêutico.