FXR1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (m): sc-420430

概要

Fxr1は、RNA結合タンパク質であるfragile X mental retardation syndrome-related protein 1（FXR1）をコードしており、mRNAの安定性・局在・翻訳の制御を通じて転写後の遺伝子発現を調節します。FXR1はリボヌクレオタンパク質（RNP）顆粒と会合し、細胞の増殖、分化、ストレス応答を形作るRNA代謝プログラムに関与します。これには、細胞骨格関連および筋関連転写産物の調節も含まれます。マウスでは、Fxr1は組織特異的な遺伝子発現や、厳密な翻訳制御が必要とされる発生過程に寄与します。文献では、FXR1依存性RNAネットワークの破綻が、増殖および生存シグナルの変化、ならびに神経発生・神経筋生物学に関連する表現型と関連づけられています。

FXR1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）は、mouse細胞株におけるFxr1遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、Fxr1内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、Fxr1のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、FXR1タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、FXR1シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、Fxr1欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• FXR1の機能に不可欠なFxr1エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、Fxr1ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• FXR1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）およびFXR1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m2）によってコードされるgRNAは、Fxr1遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  FXR1 HDRプラスミド（m）および FXR1 HDRプラスミド（m2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはFxr1ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のFxr1標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。