Barx1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (m): sc-419290

概要

Barx1（BARX homeobox 1）は、マウスにおける胚発生のパターニングや器官形成を制御するホメオボックス型転写因子であり、とりわけ頭蓋顔面の発生および前腸由来組織で重要な役割を担います。Barx1はホメオドメインを介してDNAに結合し、形態形成の過程で上皮—間葉相互作用、細胞運命の決定、細胞外マトリックスのリモデリングを協調させる転写プログラムに影響を与えます。Barx1の活性はWnt/β-カテニンやBMP経路などの発生シグナルネットワークとも交差し、分化の帰結や組織境界の形成を方向づけることがあります。Barx1関連遺伝子ネットワークの制御異常は、顔面および消化管構造に影響する先天奇形や発達障害の研究において重要です。

Barx1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）は、mouse細胞株におけるBarx1遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、Barx1内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、Barx1のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、Barx1タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、Barx1シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、Barx1欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• Barx1の機能に不可欠なBarx1エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、Barx1ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• Barx1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）およびBarx1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m2）によってコードされるgRNAは、Barx1遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  Barx1 HDRプラスミド（m）および Barx1 HDRプラスミド（m2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはBarx1ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のBarx1標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。