USP39 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-406847

Descripción general

USP39 (también conocido como homólogo de SAD1) codifica un factor asociado al espliceosoma que es esencial para el empalme del pre-ARNm, pese a carecer de actividad catalítica desubiquitinasa. Contribuye al ensamblaje y la función del tri-snRNP U4/U6·U5 y favorece la correcta eliminación de intrones, lo que vincula a USP39 con la regulación global del transcriptoma y la progresión del ciclo celular. La alteración de USP39 perturba programas de procesamiento de ARN que influyen en la proliferación, el mantenimiento del genoma y las respuestas al estrés, procesos que con frecuencia se ven modificados en el cáncer y otros trastornos proliferativos. Como resultado, USP39 se estudia ampliamente por su papel en el control de la expresión génica dependiente del empalme y en vías que regulan la fidelidad mitótica.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO USP39 (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen USP39 en líneas celulares human. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del USP39 junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de USP39 tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína USP39.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en USP39 para la investigación de la señalización de USP39, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de USP39 críticos para la función de USP39
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de USP39 para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido USP39 CRISPR/Cas9 KO (h) y el plásmido USP39 CRISPR/Cas9 KO (h2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus USP39. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR USP39 (h) y el plásmido HDR USP39 (h2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología USP39 para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana USP39 definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.