SNRPA CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-404128

Übersicht

SNRPA kodiert das U1-kleine nukleäre Ribonukleoprotein A, eine essenzielle Kernkomponente des U1-snRNP, das während des prä-mRNA-Spleißens 5′-Spleißstellen erkennt. Durch seine Beteiligung an der frühen Assemblierung des Spleißosoms unterstützt SNRPA die präzise Entfernung von Introns, die Reifung von Transkripten sowie die Koordination von Genexpressionsprogrammen, die mit Transkription und RNA-Verarbeitung gekoppelt sind. Eine Störung der U1-snRNP-Funktion kann weitreichendes alternatives Spleißen und Transkriptinstabilität auslösen – Prozesse, die häufig mit onkogener Transformation sowie neuroentwicklungsbezogenen und neurodegenerativen Phänotypen in Verbindung gebracht werden. Als grundlegender Spleißosomenfaktor wird SNRPA häufig untersucht, um die Spleißtreue mit Proteostase, Zellzykluskontrolle und stressresponsiven RNA-Regulationsnetzwerken zu verknüpfen.

Das SNRPA CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des SNRPA-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des SNRPA-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von SNRPA nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die SNRPA-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von SNRPA-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der SNRPA-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf SNRPA-Exone abzielen, die für die SNRPA-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere SNRPA-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom SNRPA CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom SNRPA CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des SNRPA-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das SNRPA HDR-Plasmid (h) und SNRPA HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von SNRPA-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten SNRPA-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.