RGPD5 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-401666

Descripción general

RGPD5 (RANBP2-like y que contiene el dominio GRIP 5) es un miembro específico de primates de la familia génica RGPD, implicado en procesos de transporte nucleocitoplasmático por su homología con dominios asociados a RANBP2/NUP358. Se cree que las proteínas de esta familia influyen en el tráfico regulado por la GTPasa Ran, la progresión mitótica y la organización espacial de complejos proteicos en la envoltura nuclear, lo que repercute en programas globales de expresión génica. Con frecuencia se menciona a RGPD5 en el contexto de duplicaciones segmentarias del cromosoma 2 y de la variabilidad en el número de copias, características que complican la interpretación específica del locus en estudios genómicos. La desregulación o la variación estructural en regiones de la familia RGPD se ha explorado en asociación con fenotipos proliferativos e inestabilidad genómica en conjuntos de datos de genómica del cáncer, lo que respalda su uso como diana para estudios mecanísticos del transporte nuclear y el control del ciclo celular.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO RGPD5 (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen RGPD5 en líneas celulares human. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del RGPD5 junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de RGPD5 tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína RGPD5.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en RGPD5 para la investigación de la señalización de RGPD5, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de RGPD5 críticos para la función de RGPD5
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de RGPD5 para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido RGPD5 CRISPR/Cas9 KO (h) y el plásmido RGPD5 CRISPR/Cas9 KO (h2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus RGPD5. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR RGPD5 (h) y el plásmido HDR RGPD5 (h2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología RGPD5 para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana RGPD5 definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.