Oct-1 겔 시프트 올리고뉴클레오타이드는 단백질-DNA 상호작용을 연구하는 데 사용되는 분자 생물학의 기본 기술인 겔 시프트 분석에 사용하도록 설계된 짧은 DNA 서열입니다. 이러한 올리고뉴클레오타이드는 전사 인자의 POU(Pit-Oct-Unc) 도메인 계열에 속하는 Oct-1 전사 인자의 합의 결합 서열에서 파생됩니다. Oct-1은 표적 유전자의 프로모터 내에 위치한 옥타머 모티프로 알려진 특정 DNA 서열에 결합하여 유전자 발현을 조절하는 데 중요한 역할을 합니다. Oct-1은 표적 부위에 결합하면 상황과 다른 조절 단백질과의 상호 작용에 따라 유전자 전사를 활성화하거나 억제할 수 있습니다. 연구자들은 겔 시프트 분석에서 Oct-1 겔 시프트 올리고뉴클레오티드를 활용하여 다양한 실험 조건에서 Oct-1과 옥타머 모티프의 결합 동역학, 특이성 및 친화성을 조사할 수 있습니다. 이 기술을 통해 Oct-1 매개 유전자 조절의 기초가 되는 분자 메커니즘을 규명하고 발달, 분화, 증식과 같은 세포 과정을 관장하는 복잡한 신호 네트워크에 대한 통찰력을 얻을 수 있습니다.
참고문헌:
- 옥타머 전사 인자-1은 인간 UDP 글루쿠로노실 트랜스퍼라제 2B7 프로모터의 간 핵 인자-1알파 매개 활성화를 향상시킵니다. | Ishii, Y., et al. 2000. Mol Pharmacol. 57: 940-7. PMID: 10779377
- 종양 괴사 인자 알파 유전자(TNFA) 프로모터의 기능적 단일염기다형성(SNP) 부위에 대한 유비쿼터스 전사 인자 OCT-1의 대립유전자 특이적 결합. | Hohjoh, H. and Tokunaga, K. 2001. Genes Immun. 2: 105-9. PMID: 11393654
- 원발성 T세포와 T세포 라인에서 옥타머 인자와 쥐 IL-5 CLE0의 결합. | Salerno, MS., et al. 2001. Cytokine. 15: 4-9. PMID: 11509003
- 3-하이드록시-3-메틸글루타릴 코엔자임 A 환원효소 억제제는 단핵 세포에서 Oct-1의 결합 활성과 핵 수준을 증가시킵니다. | Ortego, M., et al. 2002. Eur J Pharmacol. 448: 113-21. PMID: 12144930
- 마우스 유선에서 베타 카제인 유전자 발현의 전사 조절에 Oct-1의 관여. | Zhao, FQ., et al. 2002. Biochim Biophys Acta. 1577: 27-37. PMID: 12151092
- TALE 호모도메인 단백질은 독립적으로 또는 Oct-1과의 상호작용을 통해 성선자극호르몬 방출 호르몬 유전자 발현을 조절합니다. | Rave-Harel, N., et al. 2004. J Biol Chem. 279: 30287-97. PMID: 15138251
- Oct-1과 핵 인자 Y는 SURG-1 요소에 결합하여 기저 및 성선 자극 호르몬 방출 호르몬(GnRH)에 의해 자극된 마우스 GnRH 수용체 유전자 전사를 유도합니다. | Kam, KY., et al. 2005. Mol Endocrinol. 19: 148-62. PMID: 15388790
- 한방 치료제인 트립토라이드는 트립터리지움 윌포디 후크 F의 활성 성분으로, 유도성 산화질소 합성효소 유전자 전사를 감소시켜 산화질소 생성을 억제합니다. | Wang, B., et al. 2004. Arthritis Rheum. 50: 2995-303. PMID: 15457469
- c-Jun 및 옥타머 결합 단백질-1에 의한 쥐 CYP4A2 유전자 프로모터의 조절. | Fiala-Beer, E., et al. 2007. Int J Biochem Cell Biol. 39: 1235-47. PMID: 17481938
- 혈청 인터루킨-6 농도와 기능적 IL6 -6331T>C 다형성의 연관성. | Smith, AJ., et al. 2008. Clin Chem. 54: 841-50. PMID: 18356242
- 라민 B1은 Oct-1을 통해 산화 스트레스 반응을 제어합니다. | Malhas, AN., et al. 2009. J Cell Biol. 184: 45-55. PMID: 19139261
- 인간 유도성 산화질소 합성효소 유전자의 사이토카인 유도 전사를 조절하는 상류 Oct-1 모티프. | Park, KS., et al. 2009. J Mol Biol. 390: 595-603. PMID: 19467240
- 인유두종 바이러스 31b형 인핸서의 전사 활성은 AP1과 두 가지 새로운 세포 인자의 시너지 상호작용을 통해 조절됩니다. | Kyo, S., et al. 1995. Virology. 211: 184-97. PMID: 7645210
- Oct-1은 GnRH 유전자의 전사에 필요한 프로모터 요소와 결합합니다. | Eraly, SA., et al. 1998. Mol Endocrinol. 12: 469-81. PMID: 9544983