NaDC-3 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (m): sc-431118

Descripción general

Slc13a3 codifica el cotransportador murino de dicarboxilatos dependiente de sodio NaDC-3 (SLC13A3), un transportador de la membrana plasmática que acopla los gradientes de Na+ a la captación celular de dicarboxilatos como succinato, α-cetoglutarato y citrato. Al regular la disponibilidad intracelular de intermediarios del ciclo del ácido tricarboxílico y de sustratos anapleróticos, NaDC-3 influye en el flujo metabólico, el equilibrio redox y el manejo de osmólitos acoplado al transporte en tejidos con reabsorción activa de solutos. En el riñón, NaDC-3 contribuye al transporte basolateral de dicarboxilatos, lo que puede respaldar procesos de transporte de aniones orgánicos mediante intercambio de metabolitos e impacta en una homeostasis más amplia de solutos. La actividad alterada de SLC13A3 se ha vinculado a respuestas al estrés metabólico y a fenotipos renales/neurológicos en estudios genéticos y funcionales, lo que la hace relevante para investigar el diálogo entre transporte y metabolismo en modelos de enfermedad.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO NaDC-3 (m) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción selectiva del gen Slc13a3 en líneas celulares mouse. Cada plásmido del conjunto coexpresa un ARN guía específico (sgRNA) único, dirigido a un sitio distinto dentro del locus Slc13a3, junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes, y codifica GFP para permitir la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito. Esta estrategia multiguía aumenta la probabilidad de inducir desplazamientos de marco de lectura o deleciones que produzcan una inactivación funcional, ofreciendo una alternativa más robusta a los enfoques de guía única. Las DSB inducidas en múltiples sitios se resuelven mediante unión de extremos no homólogos (NHEJ) o, cuando se utiliza con la plantilla donante HDR incluida, mediante reparación dirigida por homología (HDR) en un sitio diana definido dentro del locus.

Cuando se utiliza junto con el donante HDR que expresa RFP, la fluorescencia de GFP y RFP puede utilizarse conjuntamente para distinguir las poblaciones de células transfectadas de las editadas, lo que agiliza los flujos de trabajo de clasificación y selección de clones basados en citometría de flujo.

Donante de reparación dirigida por homología (HDR) — Casete de puromicina con reportero RFP

Para aplicaciones que requieren clones knockout confirmados y seleccionables, el plásmido HDR NaDC-3 (m) incluye un constructo donante HDR que contiene un casete de resistencia a la puromicina (PuroR) y un reportero de proteína fluorescente roja (RFP), flanqueado por brazos de homología específicos de un sitio diana definido Slc13a3.
Cuando se cotransfecciona con el plásmido NaDC-3 CRISPR/Cas9 KO (m):

• El casete PuroR-RFP se integra en el sitio de corte de Cas9 mediante HDR, interrumpiendo el marco de lectura abierto Slc13a3.
  La fluorescencia de la RFP proporciona un indicador visual inmediato del éxito de la integración, lo que permite la identificación o clasificación basada en la fluorescencia de las células editadas antes o junto con la selección con puromicina.
  Las células editadas con éxito se confirman mediante la resistencia a la puromicina, lo que reduce sustancialmente la carga de cribado de clones.
  Esta estrategia de selección es ideal para generar líneas celulares KO clonales estables para estudios funcionales posteriores, cribado de fármacos o desarrollo de modelos.

Sistema de eliminación del casete Cre-lox

La construcción donante HDR cuenta con sitios loxP que flanquean el casete de selección PuroR-RFP para permitir la eliminación limpia del marcador tras la confirmación del clon. La expresión transitoria de la recombinasa Cre a través del vector Cre: sc-418923 incluido extirpa el casete, dejando un sitio loxP residual mínimo dentro del locus Slc13a3 y eliminando posibles efectos de confusión en los ensayos posteriores.
Este enfoque en dos pasos:

• Minimiza la alteración de la arquitectura local de la cromatina y de los elementos reguladores vecinos
  Restaura un contexto genómico casi nativo en el locus editado
  Permite reutilizar la estrategia de selección con puromicina en la misma línea celular para ediciones adicionales

Características principales

• gRNA dirigido a los exones Slc13a3 críticos para la función NaDC-3
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para una administración simplificada
  Donante HDR con resistencia a la puromicina para la selección positiva de clones
  Casete PuroR flanqueado por loxP con vector de recombinasa Cre para la eliminación sin fisuras del marcador
  Se suministra listo para su uso mediante transfección

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.