HoxD12 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-407472

概要

HOXD12 は、胚発生における位置情報（ポジショナル・アイデンティティ）の確立を助け、四肢および体軸骨格のパターニングを協調して制御する HOXD クラスターの一員であるホメオボックス転写因子 HoxD12 をコードします。DNA 結合性の制御因子として、HoxD12 はより広範な HOX 制御ネットワークやクロマチンレベルの制御と統合され、分化と形態形成を司る組織特異的な転写プログラムを形成します。HOXD12 の発現異常や HOX クラスター制御の破綻は発生異常と関連しており、複数のがんにおける転写シグネチャーとしても報告されています。これは、系譜決定および増殖関連遺伝子ネットワークの制御における同遺伝子の役割を反映しています。成人や疾患の文脈では、HOXD12 活性の変化が、細胞状態の遷移、遊走プログラム、発生経路の再活性化に影響し得ます。

HoxD12 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるHOXD12遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、HOXD12内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、HOXD12のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、HoxD12タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、HoxD12シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、HOXD12欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• HoxD12の機能に不可欠なHOXD12エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、HOXD12ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• HoxD12 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびHoxD12 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、HOXD12遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  HoxD12 HDRプラスミド（h）および HoxD12 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはHOXD12ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のHOXD12標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。