HIV Tat-SF1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-404479

概要

HTATSF1は、HIV Tat特異的因子1（HIV Tat-SF1）をコードしており、これは転写コファクターとして機能し、pre-mRNA処理を制御する核内RNA結合タンパク質である。HIV Tat-SF1は、RNAポリメラーゼIIによる転写とスプライソソーム活性の協調に関与し、多様な遺伝子プログラムにわたって選択的スプライシングやmRNA成熟に影響を及ぼすことが示されている。こうした転写共役的なRNAプロセシングにおける役割を通じて、HTATSF1は細胞の恒常性に寄与し、転写およびRNA代謝の精密な制御に依存する宿主—ウイルス相互作用の文脈でも研究されてきた。転写と連動したスプライシング因子の機能異常は、疾患に関連する遺伝子発現ネットワークの変化やRNA処理表現型の変容と広く関係している。

HIV Tat-SF1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるHTATSF1遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、HTATSF1内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、HTATSF1のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、HIV Tat-SF1タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、HIV Tat-SF1シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、HTATSF1欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• HIV Tat-SF1の機能に不可欠なHTATSF1エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、HTATSF1ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• HIV Tat-SF1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびHIV Tat-SF1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、HTATSF1遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  HIV Tat-SF1 HDRプラスミド（h）および HIV Tat-SF1 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはHTATSF1ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のHTATSF1標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。