DDX37 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-412866

Übersicht

DHX37 kodiert die humane ATP-abhängige RNA-Helikase DDX37, ein Protein der DEAD-Box-Familie, das an der Ribosomenbiogenese und am RNA-Stoffwechsel beteiligt ist. DDX37 wirkt an nukleolären Prozessen mit, darunter der Prozessierung von prä-rRNA und der Reifung der kleinen ribosomalen Untereinheit, und unterstützt damit eine effiziente Translation sowie das Fortschreiten des Zellzyklus. Über seine Funktionen beim RNA-helikasevermittelten Remodeling von Ribonukleoprotein-Komplexen ist DDX37 in Signalwege eingebunden, die die RNA-Prozessierung mit proliferativen Programmen koordinieren. Genetische Störungen oder eine Fehlregulation von DHX37 wurden mit entwicklungs- und reproduktionsbezogenen Phänotypen in Verbindung gebracht, was das Gen für die Untersuchung gewebespezifischer Genregulation und von Krankheitsmechanismen im Zusammenhang mit gestörter RNA-Prozessierung relevant macht.

Das DDX37 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des DHX37-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des DHX37-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von DHX37 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die DDX37-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von DHX37-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der DDX37-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf DHX37-Exone abzielen, die für die DDX37-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere DHX37-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom DDX37 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom DDX37 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des DHX37-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das DDX37 HDR-Plasmid (h) und DDX37 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von DHX37-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten DHX37-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.