COL6A2 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-403209

Übersicht

COL6A2 kodiert die α2‑Kette von Kollagen VI, einer mikrofibrillären Komponente der extrazellulären Matrix (ECM), die sich zusammen mit COL6A1 und COL6A3 zu perlschnurartigen Filamenten im Bindegewebe zusammensetzt. Kollagen VI trägt zur Organisation der ECM, zur Zell‑Matrix‑Adhäsion und zur Mechanotransduktion bei und beeinflusst dabei die Zytoskelettarchitektur sowie Signalwege wie Integrin/FAK, MAPK und TGF‑β‑assoziierte Umbauprogramme. Über diese Prozesse hilft COL6A2, die Gewebeintegrität und zelluläre Stressantworten in Fibroblasten, Myozyten und anderen Stromazelltypen zu regulieren. Eine pathogene Störung der Kollagen‑VI‑Assemblierung ist mit erblichen neuromuskulären und Bindegewebserkrankungen verknüpft, wodurch COL6A2 ein relevantes Ziel für die Modellierung ECM‑getriebener Phänotypen darstellt.

Das COL6A2 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des COL6A2-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des COL6A2-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von COL6A2 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die COL6A2-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von COL6A2-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der COL6A2-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf COL6A2-Exone abzielen, die für die COL6A2-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere COL6A2-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom COL6A2 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom COL6A2 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des COL6A2-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das COL6A2 HDR-Plasmid (h) und COL6A2 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von COL6A2-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten COL6A2-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.