IFT122 억제제는 주로 IFT122가 직접 관여하는 신호 전달 경로를 차단하는 방식으로 작용합니다. 이는 PKC 및 JNK와 같은 단백질 키나아제뿐만 아니라 IFT122를 활성화하는 것으로 알려진 Src 계열 키나아제를 억제함으로써 달성할 수 있습니다. 이러한 키나아제에 대한 특정 억제제로는 스타우로스포린, 다사티닙, SP600125, Go6983, Ro-31-8220 등이 있습니다. 이러한 화합물은 이러한 키나아제를 억제함으로써 IFT122의 활성화를 감소시킬 수 있습니다. 또한, NF-κB 경로는 IFT122를 활성화하는 것으로 알려져 있으므로 NF-κB 활성화를 감소시키는 BAY 11-7082 및 BAY 11-7085와 같은 억제제는 IFT122의 활성화 감소로 이어질 수 있습니다.
또한, MAPK 경로, 특히 MEK 성분은 IFT122를 활성화하는 것으로 알려져 있습니다. 따라서 PD98059 및 U0126과 같은 MEK 억제제는 IFT122 활성화를 감소시킬 수 있습니다. 또한 PI3K 및 mTOR 신호 경로는 IFT122를 활성화하는 것으로 알려져 있으므로 각각 PI3K 및 mTOR를 차단하는 LY294002 및 라파마이신과 같은 억제제를 사용하면 IFT122 활성화를 감소시킬 수 있습니다. 이러한 특정 생화학적 경로를 통해 IFT122의 활성은 나열된 화합물에 의해 직간접적으로 억제될 수 있습니다.
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