TRIM41 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-413871

概要

TRIM41は、RINGフィンガー型E3ユビキチンリガーゼ活性をもつトリパルタイトモチーフ（TRIM）タンパク質をコードしており、ユビキチン依存的なプロテオスタシス（タンパク質恒常性）やシグナル伝達複合体の制御に寄与します。TRIMファミリーのネットワークの一員として、TRIM41はタンパク質の安定性と分解回転（ターンオーバー）の制御に関与し、自然免疫の調節、ストレス応答、細胞恒常性の維持に関連する経路に影響を与えることが示唆されています。TRIMタンパク質が関わるユビキチン化ダイナミクスの変化は、炎症性シグナルの異常や腫瘍性表現型と関連づけられており、TRIM41はユビキチン経路が疾患関連の細胞状態に与える寄与を解析するための有用な標的となります。TRIM41の機能解析は、基質認識、翻訳後修飾間のクロストーク、ならびに転写産物・プロテオーム出力に対する経路レベルの影響の研究を支えます。

TRIM41 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるTRIM41遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、TRIM41内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、TRIM41のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、TRIM41タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、TRIM41シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、TRIM41欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• TRIM41の機能に不可欠なTRIM41エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、TRIM41ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• TRIM41 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびTRIM41 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、TRIM41遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  TRIM41 HDRプラスミド（h）および TRIM41 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはTRIM41ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のTRIM41標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。