TDRD1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-410043

概要

TDRD1（Tudor domain containing 1）は、生殖細胞で高発現するRNA結合タンパク質で、PIWIファミリータンパク質上の対称性ジメチル化アルギニン残基を認識し、piRNA経路の構築（アセンブリ）を支えます。これらの相互作用を介して、TDRD1はpiRNAの生合成と生殖顆粒の組織化を協調させることで、トランスポゾンのサイレンシング、ゲノム完全性の維持、ならびに精子形成の適切な進行に寄与します。TDRD1依存的なpiRNA監視機構の破綻は、雄性生殖細胞の発生異常や生殖能低下と関連しており、生殖系列ゲノムを保護するうえでの中核的役割を反映しています。さらに、TDRD1の発現変化やTDRD1を含む生殖系列プログラムの破綻は、がん・精巣抗原（cancer-testis antigen）の生物学や腫瘍におけるエピジェネティックな制御異常の文脈でも研究されています。

TDRD1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるTDRD1遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、TDRD1内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、TDRD1のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、TDRD1タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、TDRD1シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、TDRD1欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• TDRD1の機能に不可欠なTDRD1エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、TDRD1ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• TDRD1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびTDRD1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、TDRD1遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  TDRD1 HDRプラスミド（h）および TDRD1 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはTDRD1ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のTDRD1標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。