SUMO-3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-400788

概要

SUMO3は、標的タンパク質に共有結合して付加され、その局在、安定性、相互作用ネットワークを調節する小型のユビキチン様修飾因子であるSUMO-3をコードしています。SUMO-3依存的なSUMO化は、転写、DNA損傷シグナル伝達と修復、クロマチン構造、細胞周期進行の動的制御を支えるとともに、ユビキチン経路とも交差して、ストレス適応的なプロテオスタシスの形成に関与します。SUMO3の機能は、細胞ストレス応答、ゲノム完全性の維持、自然免疫制御といった文脈でしばしば研究されており、SUMO化パターンの変化は、がん生物学におけるシグナル伝達の破綻、神経変性に関連するプロテオトキシック・ストレス、炎症性病態の異常と関連づけられています。

SUMO-3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるSUMO3遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、SUMO3内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、SUMO3のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、SUMO-3タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、SUMO-3シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、SUMO3欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• SUMO-3の機能に不可欠なSUMO3エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、SUMO3ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• SUMO-3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびSUMO-3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、SUMO3遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  SUMO-3 HDRプラスミド（h）および SUMO-3 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはSUMO3ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のSUMO3標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。