SNRPA CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-404128

概要

SNRPAは、pre-mRNAスプライシングの過程で5′スプライス部位を認識するU1 snRNPの必須コア構成要素である、U1小核リボヌクレオタンパク質Aをコードします。スプライソソームの初期組み立てに関与することで、SNRPAはイントロンの正確な除去、転写産物の成熟、ならびに転写とRNAプロセシングに連動した遺伝子発現プログラムの協調を支えます。U1 snRNP機能の破綻は、広範な選択的スプライシングや転写産物の不安定化を引き起こし得ますが、これらの過程は腫瘍化や神経発達・神経変性表現型としばしば関連づけられています。基盤的なスプライソソーム因子として、SNRPAはスプライシングの忠実性と、プロテオスタシス、細胞周期制御、ストレス応答性のRNA制御ネットワークとの関連を結び付けて検討するために広く研究されています。

SNRPA CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるSNRPA遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、SNRPA内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、SNRPAのオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、SNRPAタンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、SNRPAシグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、SNRPA欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• SNRPAの機能に不可欠なSNRPAエクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、SNRPAゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• SNRPA CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびSNRPA CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、SNRPA遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  SNRPA HDRプラスミド（h）および SNRPA HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはSNRPAホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のSNRPA標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。