Sm D3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-405302

概要

SNRPD3はSm D3コアタンパク質をコードしており、これはsnRNAに結合してスプライソソーム小核リボ核タンパク質（snRNP）を形成する際に組み立てられるSmリングの、保存性の高い構成要素です。Sm D3はsnRNPの生合成とpre-mRNAスプライシングの忠実性を支え、スプライソソームのアセンブリ動態およびRNAプロセシングの品質管理と関連しています。Smコアタンパク質の機能が撹乱されると、転写産物アイソフォームの利用が変化し、細胞周期の進行、ストレス応答、分化を制御する遺伝子発現プログラムに影響を及ぼし得ます。異常スプライシングは多くの疾患状態に共通する特徴であるため、SNRPD3は、スプライソソームの完全性とヒト細胞におけるゲノムワイドなRNA成熟表現型を結び付ける結節点として、しばしば研究されています。

Sm D3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるSNRPD3遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、SNRPD3内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、SNRPD3のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、Sm D3タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、Sm D3シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、SNRPD3欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• Sm D3の機能に不可欠なSNRPD3エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、SNRPD3ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• Sm D3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびSm D3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、SNRPD3遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  Sm D3 HDRプラスミド（h）および Sm D3 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはSNRPD3ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のSNRPD3標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。