SETMAR CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-417901

概要

SETMAR（Metnase とも呼ばれる）は、SETドメインを有するヒトのリジンメチルトランスフェラーゼであり、mariner トランスポザーゼ由来ドメインと融合した構造を持ち、クロマチン修飾とDNA末端処理を協調させます。非相同末端結合（NHEJ）を調節し、複製に伴うストレス応答に影響を与えることで、DNA二本鎖切断修復およびゲノム維持に関与します。修復因子やクロマチン構成要素との相互作用を介して、SETMARは損傷部位における転写制御やクロマチンアクセシビリティにも影響を及ぼし得ます。SETMARの活性や発現の異常は、DNA修復能の変化やゲノム不安定性と関連づけられており、がん生物学、放射線感受性、薬剤応答機構の研究において重要です。

SETMAR CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるSETMAR遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、SETMAR内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、SETMARのオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、SETMARタンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、SETMARシグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、SETMAR欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• SETMARの機能に不可欠なSETMARエクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、SETMARゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• SETMAR CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびSETMAR CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、SETMAR遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  SETMAR HDRプラスミド（h）および SETMAR HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはSETMARホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のSETMAR標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。