SDS3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-413010

概要

SUDS3はSDS3をコードしており、SDS3はクロマチンリモデリングとヒストン脱アセチル化を結び付けるSin3A/HDAC転写コリプレッサー複合体の中核構成要素です。HDAC1/2および関連因子のリクルートを介して、SDS3は細胞周期の進行、系譜（ラインエージ）指定、ならびに発生やストレス刺激に対する応答を形作る転写抑制プログラムに寄与します。SDS3依存的なクロマチン制御はゲノム安定性とエピジェネティック恒常性に影響し、複合体の組成や活性の変化を異常な遺伝子発現状態と結び付けます。Sin3/HDACを介した抑制や関連するエピジェネティック経路の破綻は、がん生物学でしばしば関与が示されるほか、より広い文脈では神経発生や分化に関連する表現型にも関係します。

SDS3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるSUDS3遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、SUDS3内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、SUDS3のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、SDS3タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、SDS3シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、SUDS3欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• SDS3の機能に不可欠なSUDS3エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、SUDS3ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• SDS3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびSDS3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、SUDS3遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  SDS3 HDRプラスミド（h）および SDS3 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはSUDS3ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のSUDS3標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。