RPRD1B CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-412911

概要

RPRD1B は、RNAポリメラーゼIIの CTD（C 末端ドメイン）と相互作用する制御因子をコードしており、ポリメラーゼ CTD のリン酸化状態を調節することで、転写の開始・伸長・終結の協調を助けます。転写制御を mRNA プロセシングと結び付けることにより、RPRD1B は細胞周期やストレス応答性の転写ネットワークを含む、全体的な遺伝子発現プログラムに寄与します。RPRD1B の発現または機能の破綻は、がんに関連する状況で観察される転写恒常性の変化と関連付けられており、RNAポリメラーゼIIの動態の変化が増殖やゲノム安定性に影響し得ます。核内の転写調節因子として、転写と共役した RNA プロセシングやクロマチン関連制御の機構研究においても重要です。

RPRD1B CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるRPRD1B遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、RPRD1B内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、RPRD1Bのオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、RPRD1Bタンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、RPRD1Bシグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、RPRD1B欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• RPRD1Bの機能に不可欠なRPRD1Bエクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、RPRD1Bゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• RPRD1B CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびRPRD1B CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、RPRD1B遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  RPRD1B HDRプラスミド（h）および RPRD1B HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはRPRD1Bホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のRPRD1B標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。