Plasmide CRISPR/Cas9 KO RBMX (h): sc-417339

Présentation

RBMX (RNA binding motif protein X-linked) humain est une protéine nucléaire de liaison à l’ARN qui s’associe aux transcrits naissants et contribue à l’épissage du pré‑ARNm, à la maturation de l’ARNm et à la coordination de la transcription avec le traitement de l’ARN. RBMX a été associé au maintien du génome via des rôles dans la réponse aux dommages de l’ADN et dans des processus liés à la réplication, favorisant la préservation de l’intégrité chromosomique au cours de la progression du cycle cellulaire. Par sa participation à des voies liées au spliceosome et à la régulation du profil d’isoformes transcrites, RBMX peut influencer des programmes d’expression génique contrôlant la prolifération et les réponses au stress. Une dérégulation de l’expression ou de la fonction de RBMX a été rapportée dans des contextes liés au cancer et au développement, où une altération du traitement de l’ARN et de la stabilité du génome constitue des caractéristiques pathogènes fréquentes.

Le plasmide CRISPR/Cas9 KO RBMX (h) est un ensemble de plasmides conçus pour la disruption ciblée du gène RBMX dans les lignées cellulaires human. Chaque plasmide co-exprime un ARN guide unique (sgRNA) ciblant un site distinct au sein du RBMX, ainsi que la nucléase Cas9 de Streptococcus pyogenes. Les plasmides codent également pour la GFP, ce qui permet l'identification par fluorescence et l'enrichissement des cellules transfectées avec succès par microscopie à fluorescence ou cytométrie en flux.

La conception multi-guide augmente la probabilité de générer des insertions ou des délétions (indels) qui perturbent le cadre de lecture ouvert RBMX à la suite de la formation de cassures double brin médiées par Cas9. Les cassures d'ADN introduites par le système CRISPR/Cas9 sont réparées par des voies endogènes de jonction non homologue (NHEJ), ce qui entraîne fréquemment des mutations par décalage du cadre de lecture qui suppriment l'expression de la protéine RBMX.

Ce système de knock-out CRISPR permet la génération efficace de modèles cellulaires déficients en RBMX pour l'étude de la signalisation de RBMX, les études de génomique fonctionnelle, la recherche en biologie du cancer et l'évaluation des réponses thérapeutiques dans des lignées cellulaires humaines.

Caractéristiques principales

• sgRNA ciblant le ou les exons de RBMX essentiels à la fonction de RBMX
  Co-expression de SpCas9 et de sgRNA à partir d'un seul plasmide pour une administration simplifiée
  Rapporteur GFP pour l'identification des cellules transfectées
  Pool de plasmides ciblant plusieurs sites génomiques de RBMX pour améliorer l'efficacité du knock-out
  Compatible avec l'administration par transfection

Variantes de conception

CRISPR +/- HDR

• Les gRNA codés par le RBMX plasmide CRISPR/Cas9 KO (h) et le RBMX plasmide CRISPR/Cas9 KO (h2) ciblent des sites distincts au sein du locus RBMX. Une ou les deux conceptions de ciblage peuvent être disponibles. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.
  Les constructions donneuses HDR codées par le RBMX plasmide HDR (h) et le RBMX (h2) contiennent une cassette de résistance à la puromycine et un rapporteur RFP flanqué de bras d'homologie RBMX pour permettre la réparation dirigée par homologie au niveau de sites cibles RBMX définis correspondant aux conceptions CRISPR/Cas9 KO. La disponibilité des donneurs HDR peut varier. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.

Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.