RBM47 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (m): sc-434185

概要

Rbm47は、転写産物に結合して転写後の遺伝子制御（mRNAの安定性、スプライシング、RNA編集の帰結など）に影響を与えるRNA結合タンパク質RBM47をコードします。RBM47は、APOBEC1依存的なシチジンからウリジンへの（C-to-U）RNA編集経路と関連づけられており、上皮系および消化管の文脈で転写産物の多様化に寄与します。RNAプロセシングのプログラムを調節することで、RBM47は分化や上皮の完全性といった細胞状態の決定に影響し得るほか、がんや炎症に関連する状況における遺伝子発現シグネチャーの破綻との関連も報告されています。マウス系では、Rbm47の改変は、シグナル伝達ネットワークや組織恒常性に対するRNA中心の制御を解明するための扱いやすいアプローチとなります。

RBM47 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）は、mouse細胞株におけるRbm47遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、Rbm47内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、Rbm47のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、RBM47タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、RBM47シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、Rbm47欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• RBM47の機能に不可欠なRbm47エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、Rbm47ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• RBM47 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）およびRBM47 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m2）によってコードされるgRNAは、Rbm47遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  RBM47 HDRプラスミド（m）および RBM47 HDRプラスミド（m2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはRbm47ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のRbm47標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。