OTUB2 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-413099

概要

OTUB2（OTU deubiquitinase, ubiquitin aldehyde binding 2）は、ユビキチンシグナルを編集してタンパク質の安定性やシグナル伝達の強度を調節する、システインプロテアーゼ型の脱ユビキチン化酵素（DUB）をコードしています。特定のユビキチン鎖結合様式を選択的に切断することで、OTUB2はプロテオスタシス、DNA損傷応答、ストレス適応性のシグナル伝達カスケードを制御するユビキチン依存性経路に影響を与えます。OTUB2活性の変化は、がん原性シグナル伝達プログラムや炎症性病態生理を含む複数の疾患状況でみられるユビキチン恒常性の破綻と関連づけられています。そのためOTUB2は、ユビキチン化、転写制御、細胞の生存／死の意思決定の間に存在する経路間クロストークへの影響という観点から、しばしば研究対象となっています。

OTUB2 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるOTUB2遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、OTUB2内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、OTUB2のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、OTUB2タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、OTUB2シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、OTUB2欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• OTUB2の機能に不可欠なOTUB2エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、OTUB2ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• OTUB2 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびOTUB2 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、OTUB2遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  OTUB2 HDRプラスミド（h）および OTUB2 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはOTUB2ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のOTUB2標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。