matrin-3 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-418085

Panoramica

MATR3 codifica la matrin-3, una proteina di legame RNA/DNA della matrice nucleare che si associa alla lamina nucleare e alla cromatina per sostenere l’architettura del nucleo e l’organizzazione del genoma. Matrin-3 partecipa all’elaborazione dell’RNA, inclusi lo splicing del pre-mRNA, la stabilizzazione dell’mRNA e la regolazione dell’espressione genica tramite interazioni con complessi ribonucleoproteici. Le sue funzioni si intersecano con vie che governano l’organizzazione nucleo-citoplasmatica, le risposte al danno al DNA e la dinamica dei granuli da stress, collegando MATR3 alla proteostasi e all’omeostasi dell’RNA nei neuroni. La disregolazione o le mutazioni di MATR3 sono state associate a fenotipi neurodegenerativi, inclusi disturbi dello spettro SLA/FTD, rendendolo rilevante per studi sulla disfunzione delle proteine leganti l’RNA e sui difetti strutturali nucleari.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO matrin-3 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene MATR3 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del MATR3 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto MATR3 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina matrin-3.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di MATR3 per lo studio della segnalazione di matrin-3, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni MATR3 critici per la funzione di matrin-3
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di MATR3 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal matrin-3 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal matrin-3 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus MATR3. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal matrin-3 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR matrin-3 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia MATR3 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio MATR3 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.