HS3ST6 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-408948

概要

HS3ST6は、ヘパラン硫酸-グルコサミン 3-O-スルホトランスフェラーゼ6をコードしており、ゴルジ体に局在する酵素としてヘパラン硫酸鎖の3-O-硫酸化を触媒します。これにより、ヘパラン硫酸‐タンパク質相互作用の在り方を左右する、比較的稀な硫酸化モチーフが形成されます。ヘパラン硫酸プロテオグリカンの微細構造を調節することで、HS3ST6は細胞外マトリックスや細胞表面におけるシグナル伝達の文脈で、リガンド結合や濃度勾配の形成に影響し、細胞接着、遊走、受容体媒介性シグナル伝達などの過程に関与します。ヘパラン硫酸の硫酸化パターンの変化は、増殖因子やサイトカインのシグナル伝達の破綻と関連しており、腫瘍生物学や炎症性微小環境との関連も報告されています。そのため、HS3ST6はグリコサミノグリカン依存的な制御機構を解明するためのメカニズム研究に有用な標的となります。

HS3ST6 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるHS3ST6遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、HS3ST6内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、HS3ST6のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、HS3ST6タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、HS3ST6シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、HS3ST6欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• HS3ST6の機能に不可欠なHS3ST6エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、HS3ST6ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• HS3ST6 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびHS3ST6 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、HS3ST6遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  HS3ST6 HDRプラスミド（h）および HS3ST6 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはHS3ST6ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のHS3ST6標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。