GATAD1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-403468

概要

GATAD1（GATA zinc finger domain containing 1）は、DNA結合およびタンパク質間相互作用を介した転写制御に関与するとされる、核内のクロマチン関連タンパク質をコードしています。GATAD1は亜鉛フィンガードメインを通じて、細胞増殖、分化、ストレス適応応答に影響する遺伝子発現プログラムの制御に関与し、しばしばエピジェネティック修飾因子やクロマチンリモデリング複合体と協調して働くことが示唆されています。GATAD1の発現量やコピー数の変化は複数の腫瘍で報告されており、がん性の転写状態やゲノム規模の制御ネットワークの攪乱への寄与という観点から関心が持たれています。そのためGATAD1は、クロマチン制御機構、転写因子回路、ならびにがん関連シグナルのクロストークの研究で頻繁に解析対象となっています。

GATAD1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるGATAD1遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、GATAD1内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、GATAD1のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、GATAD1タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、GATAD1シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、GATAD1欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• GATAD1の機能に不可欠なGATAD1エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、GATAD1ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• GATAD1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびGATAD1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、GATAD1遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  GATAD1 HDRプラスミド（h）および GATAD1 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはGATAD1ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のGATAD1標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。