G530011O06Rik CRISPR/Cas9 KOプラスミド (m): sc-437289

概要

マウスのG530011O06Rikは、機能アノテーションが限られた、未解明な点の多いタンパク質をコードしており、遺伝子制御や細胞恒常性に関する探索的研究の標的として有用です。ゲノム上の周辺環境や発現プロファイリングに基づく既存の証拠から、細胞種や発生段階に応じて、転写制御、RNA代謝、細胞内シグナル伝達といった基礎的プロセスに関与する可能性が示唆されています。多くのRIKEN cDNA遺伝子は哺乳類で保存されたゲノム領域に対応しているため、G530011O06Rikを撹乱することで、注釈の乏しいタンパク質が経路構造や表現型にどのように寄与するかを明確にする手がかりになります。系統的な機能喪失（loss-of-function）解析は、ストレス応答、分化プログラム、あるいはマウスモデル系における疾患関連分子シグネチャーとの関連を同定する上で有益となる可能性があります。

G530011O06Rik CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）は、mouse細胞株におけるG530011O06Rik遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、G530011O06Rik内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、G530011O06Rikのオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、G530011O06Rikタンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、G530011O06Rikシグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、G530011O06Rik欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• G530011O06Rikの機能に不可欠なG530011O06Rikエクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、G530011O06Rikゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• G530011O06Rik CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）およびG530011O06Rik CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m2）によってコードされるgRNAは、G530011O06Rik遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  G530011O06Rik HDRプラスミド（m）および G530011O06Rik HDRプラスミド（m2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはG530011O06Rikホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のG530011O06Rik標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。