FSD1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-406328

概要

FSD1（fibronectin type III and SPRY domain containing 1）は、SPRYドメインおよびフィブロネクチンIII様ドメインを含む細胞質タンパク質をコードしており、タンパク質間相互作用やシグナル伝達複合体の制御に関与する可能性が示唆されています。報告されている機能的関連から、FSD1は細胞骨格の組織化や微小管関連プロセスの制御に関与し、細胞構築、細胞内輸送、ストレス応答に影響を及ぼし得ると考えられます。がんデータセットではFSD1の発現変動やゲノム異常が報告されており、増殖、遊走、細胞の適応性（フィットネス）に影響する機構を研究するための候補遺伝子としての有用性が支持されています。比較的解析が進んでいない因子であることから、ドメイン依存的な足場（スキャフォールド）タンパク質を下流のシグナル出力へと結び付ける経路を探索する研究においても、FSD1は重要な対象となります。

FSD1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるFSD1遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、FSD1内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、FSD1のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、FSD1タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、FSD1シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、FSD1欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• FSD1の機能に不可欠なFSD1エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、FSD1ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• FSD1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびFSD1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、FSD1遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  FSD1 HDRプラスミド（h）および FSD1 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはFSD1ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のFSD1標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。