Plasmide CRISPR/Cas9 KO FOXQ1 (h): sc-403650

Présentation

FOXQ1 (forkhead box Q1) code un facteur de transcription de la famille forkhead qui régule les programmes de lignée épithéliale, la différenciation cellulaire et des réseaux transcriptionnels dépendants du contexte impliqués dans la motilité et le remodelage tissulaire. L’activité de FOXQ1 a été associée à la modulation de l’expression de gènes liés à la transition épithélio-mésenchymateuse (EMT) ainsi qu’au dialogue avec les voies de signalisation Wnt/β-caténine et TGF-β, influençant l’adhérence et la dynamique du cytosquelette. Une expression dérégulée de FOXQ1 est rapportée dans de multiples types de tumeurs et est fréquemment associée à des signatures transcriptionnelles altérées liées à l’invasion et au potentiel métastatique. En tant que régulateur transcriptionnel se liant à l’ADN, FOXQ1 est également utilisé pour étudier la logique des promoteurs/activateurs (enhancers) et le contrôle associé à la chromatine de l’expression génique épithéliale.

Le plasmide CRISPR/Cas9 KO FOXQ1 (h) est un ensemble de plasmides conçus pour la disruption ciblée du gène FOXQ1 dans les lignées cellulaires human. Chaque plasmide co-exprime un ARN guide unique (sgRNA) ciblant un site distinct au sein du FOXQ1, ainsi que la nucléase Cas9 de Streptococcus pyogenes. Les plasmides codent également pour la GFP, ce qui permet l'identification par fluorescence et l'enrichissement des cellules transfectées avec succès par microscopie à fluorescence ou cytométrie en flux.

La conception multi-guide augmente la probabilité de générer des insertions ou des délétions (indels) qui perturbent le cadre de lecture ouvert FOXQ1 à la suite de la formation de cassures double brin médiées par Cas9. Les cassures d'ADN introduites par le système CRISPR/Cas9 sont réparées par des voies endogènes de jonction non homologue (NHEJ), ce qui entraîne fréquemment des mutations par décalage du cadre de lecture qui suppriment l'expression de la protéine FOXQ1.

Ce système de knock-out CRISPR permet la génération efficace de modèles cellulaires déficients en FOXQ1 pour l'étude de la signalisation de FOXQ1, les études de génomique fonctionnelle, la recherche en biologie du cancer et l'évaluation des réponses thérapeutiques dans des lignées cellulaires humaines.

Caractéristiques principales

• sgRNA ciblant le ou les exons de FOXQ1 essentiels à la fonction de FOXQ1
  Co-expression de SpCas9 et de sgRNA à partir d'un seul plasmide pour une administration simplifiée
  Rapporteur GFP pour l'identification des cellules transfectées
  Pool de plasmides ciblant plusieurs sites génomiques de FOXQ1 pour améliorer l'efficacité du knock-out
  Compatible avec l'administration par transfection

Variantes de conception

CRISPR +/- HDR

• Les gRNA codés par le FOXQ1 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h) et le FOXQ1 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h2) ciblent des sites distincts au sein du locus FOXQ1. Une ou les deux conceptions de ciblage peuvent être disponibles. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.
  Les constructions donneuses HDR codées par le FOXQ1 plasmide HDR (h) et le FOXQ1 (h2) contiennent une cassette de résistance à la puromycine et un rapporteur RFP flanqué de bras d'homologie FOXQ1 pour permettre la réparation dirigée par homologie au niveau de sites cibles FOXQ1 définis correspondant aux conceptions CRISPR/Cas9 KO. La disponibilité des donneurs HDR peut varier. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.

Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.