FAM55D CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-412343

概要

NXPE4 は、ヒトタンパク質 FAM55D をコードしており、分泌型または膜関連型で、神経系で高発現すると予測される neurexophilin／PC-esterase ドメインタンパク質ファミリーの一員です。分子機能はまだ十分に解明されていませんが、ファミリーの特徴から、細胞外でのタンパク質間相互作用や細胞間コミュニケーションに関わり、神経回路の結合性やシナプス構造の形成・維持に影響を与える可能性が示唆されます。トランスクリプトレベルでのバリアントや組織特異的な発現パターンはゲノミクスデータセットで検討されており、脳の発生と機能を形作る制御ネットワークの中で NXPE4 を理解するため、神経生物学領域での継続的な研究が支持されています。さらに、疾患に関連するコホートを用いた関連解析では NXPE4 の発現変動が報告されており、その攪乱が細胞表現型にどのような影響を与えるのかを明らかにする機構研究の必要性が示されています。

FAM55D CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるNXPE4遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、NXPE4内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、NXPE4のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、FAM55Dタンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、FAM55Dシグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、NXPE4欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• FAM55Dの機能に不可欠なNXPE4エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、NXPE4ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• FAM55D CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびFAM55D CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、NXPE4遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  FAM55D HDRプラスミド（h）および FAM55D HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはNXPE4ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のNXPE4標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。