FAM188B Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-413571

Panoramica

FAM188B codifica una proteina umana scarsamente caratterizzata, implicata nella regolazione dell’omeostasi proteica e della segnalazione attraverso presunte associazioni con il turnover ubiquitina-dipendente e con le reti di proteostasi. Evidenze emergenti collegano FAM188B alla proliferazione cellulare e alle risposte adattative allo stress, suggerendone la rilevanza in vie che coordinano la progressione del ciclo cellulare, la segnalazione di sopravvivenza e l’adattamento a condizioni proteotossiche. Sono stati riportati pattern di espressione alterati in molteplici tipi di tumore, a supporto dell’indagine di FAM188B come modulatore di fenotipi oncogeni e di vulnerabilità dipendenti dal contesto. Nonostante una definizione meccanicistica ancora limitata, FAM188B rappresenta un bersaglio utile per comprendere come la regolazione del proteoma si interfacci con il controllo della crescita e con la fitness cellulare.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO FAM188B (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene FAM188B in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del FAM188B insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto FAM188B a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina FAM188B.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di FAM188B per lo studio della segnalazione di FAM188B, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni FAM188B critici per la funzione di FAM188B
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di FAM188B per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal FAM188B CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal FAM188B CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus FAM188B. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal FAM188B Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR FAM188B (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia FAM188B per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio FAM188B definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.