FAM118B CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-413182

概要

FAM118B は、基本的な細胞恒常性に関与すると予測されているものの、特徴づけが十分でないヒトタンパク質をコードします。近年、FAM118 ファミリーのメンバーが RNA 関連プロセスや核内組織化に関与することを示す証拠が蓄積しつつあります。組織横断的にみられる FAM118B の基礎発現は、細胞周期の進行、ストレス応答、プロテオスタシス（タンパク質恒常性）ネットワークと交差する中核的な遺伝子発現プログラムの維持に役割を持つ可能性を示唆します。発現パターンの変化はマルチオミクスがんデータセットや他の疾患文脈でも報告されており、腫瘍生物学や細胞のフィットネスに関する研究における候補制御因子としての利用を支持します。分子機能が未解明な点が残るため、FAM118B は遺伝学的摂動を用いて下流経路や相互作用パートナーを同定する、仮説駆動型の解析に適しています。

FAM118B CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるFAM118B遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、FAM118B内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、FAM118Bのオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、FAM118Bタンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、FAM118Bシグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、FAM118B欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• FAM118Bの機能に不可欠なFAM118Bエクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、FAM118Bゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• FAM118B CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびFAM118B CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、FAM118B遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  FAM118B HDRプラスミド（h）および FAM118B HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはFAM118Bホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のFAM118B標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。